اهداف سازمانی:
1- بررسی علوم نوین و تطبیق با دیدگاه‌های علوم دینی؛
1-1- بررسی امکان تطبیق نظریات بیوتکنولوژی و نانوتکنولوژی و علوم مرتبط به ریزذرات با علوم دینی؛
1-2- بررسی امکان تطبیق پزشکی نوین، زیست‌شناسی نوین، علوم جانوری و گیاهی نوین، فیزیک نوین، شیمی نوین، اقتصاد و فلسفه‌های نوین و علوم تربیتی و روان‌شناسی با علوم دینی.
2- پژوهش در عرصه‌های بنیادین علوم نوین به‌منظور ارائۀ نظریه‌های بدیع و راهگشا در علوم دینی؛
2-1- پژوهش جهت ارائۀ نظریات جدید در علوم بیوتکنولوژی، نانوتکنولوژی و علوم مرتبط به ریزذرات، پزشکی نوین، زیست‌شناسی نوین، علوم جانوری و گیاهی نوین، فیزیک نوین، شیمی نوین، اقتصاد، فلسفه‌های نوین و علوم تربیتی و روان‌شناسی به موازات پژوهش در علوم دینی؛
2-2- استفاده از کلیدواژه‌های موجود در علوم دینی متناسب با فناوری‌های نوین به‌منظور دستیابی به عناوین مهم پژوهشی؛
2-3- ارتقای سطح کیفی علوم دینی در اجتماعات علمی - پژوهشی و بارورسازی فرهنگ نظریه‌پردازی در عرصه‌های کلیدی فناوری؛
2-4- طرح سؤالات مهم و کلیدی در مسائل بنیادین علمی و دینی به‌منظور دستیابی به افق‌های نویدبخش؛
2-5- بالابردن ظرفیت درک علمی از دین و ایجاد پایگاه علمی شایسته و قابل رقابت جهانی در این زمینه؛
2-6- استقبال از نواندیشی و دگراندیشی در زمینه‌های علوم دینی با استفاده از پیشرفت‌های تازه در فناوری‌های نوین به‌منظور خرافات‌زدایی و ارتقای جایگاه دین؛
2-7- ایجاد بسترهای علمی - تخصصی مناسب جهت کمک به فقها و علماء در استفتائات نوین دینی و فراهم‌آوردن پشتوانه‌های علمی - تخصصی در ایجاد تحولات احتمالی در نظریات دینی؛
3- فراهم‌سازی بسترهای پژوهشی در زمینۀ نوفناوری‌ها با استفاده از پشتوانۀ علوم دینی؛
4- پرداختن تخصصی به نظریات و فناوری‌های نوین که واجد ملاحظات اخلاقی – اجتماعی - دینی هستند.
5- ارائۀ راهکارها و طرح‌های مربوط به نوفناوری با استفاده از منابع تخصصی علمی و دینی؛
6- مطالعه و پژوهش در فناوری‌های کلیدی که امکان اثرگذاری آنها در عرصه‌های اجتماعی-دینی-علمی وجود دارد.
7- جذب، تشویق و ترغیب محققان و دانشجویان جهت انجام تحقیقات کاربردی در زمینۀ علوم مذکور و ارتباط آنها با علوم دینی و نوآوری در آنها؛
8- تربیت نیروی انسانی ماهر مورد نیاز برای انجام تحقیقات علمی-دینی برای سایر مراکز دانشگاهی؛
9- فراهم‌سازی دانش پایه برای سیاستگذاری توسعۀ علمی در حوزۀ پژوهش‌های مشترک میان علوم دینی و غیر آن.